les synos gèrent les hôtes virtuels. C'est la meilleure solution pour un hébergement multisite.
du coup, la solution pour ton nom de domaine est d'utiliser le dns.
il suffit de créer autant de CNAME (ou de type A, mais c'est moins souple) que de sites à héberger sur ton syno.
pour cela, tu crées un type A pointant sur ton IP, puis des CNAME pointant sur ce type A.
chaque CNAME correspond à l'adresse du site que tu configures sur le syno dans les hôtes virtuels.
si tu as plusieurs domaine, c'est pareil.
exemple, tu as les domaines domaine1.fr et domaine2.fr
tu crées un type A pour syno.domaine1.fr et un type A pour syno.domaine2.fr
pour ton premier site, tu crées un CNAME www pointant sur syno, et sur le syno tu mets www.domaine1.fr et le chemin d'accès au site
idem pour le second.